Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN3Q969G5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms