Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJD3Q8N144 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJD3Q8N144 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms