Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms