Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms