Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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