Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZFHX3Q15911 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms