Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL9A3Q14050 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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