Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
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SHROOM2Q13796 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
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SHROOM2Q13796 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
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SHROOM2Q13796 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
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