Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO2Q13137 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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CALCOCO2Q13137 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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CALCOCO2Q13137 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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CALCOCO2Q13137 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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CALCOCO2Q13137 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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CALCOCO2Q13137 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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