Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SSRP1Q08945 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms