Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERFP50548 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERFP50548 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERFP50548 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERFP50548 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERFP50548 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERFP50548 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERFP50548 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERFP50548 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERFP50548 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERFP50548 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERFP50548 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERFP50548 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERFP50548 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERFP50548 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERFP50548 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERFP50548 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERFP50548 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERFP50548 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERFP50548 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERFP50548 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERFP50548 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERFP50548 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERFP50548 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERFP50548 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms