Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms