Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5CP41229 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms