Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GJA4P35212 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GJA4P35212 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GJA4P35212 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GJA4P35212 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA4P35212 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA4P35212 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA4P35212 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA4P35212 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA4P35212 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA4P35212 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA4P35212 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA4P35212 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA4P35212 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA4P35212 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA4P35212 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA4P35212 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA4P35212 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA4P35212 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA4P35212 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA4P35212 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJA4P35212 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms