Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBL1P28749 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBL1P28749 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBL1P28749 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBL1P28749 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RBL1P28749 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBL1P28749 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBL1P28749 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBL1P28749 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBL1P28749 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBL1P28749 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBL1P28749 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBL1P28749 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBL1P28749 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBL1P28749 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBL1P28749 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBL1P28749 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBL1P28749 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBL1P28749 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBL1P28749 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBL1P28749 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBL1P28749 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBL1P28749 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms