Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRZ1P23471 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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