Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSPP15924 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DSPP15924 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSPP15924 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSPP15924 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DSPP15924 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSPP15924 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSPP15924 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSPP15924 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSPP15924 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSPP15924 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSPP15924 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSPP15924 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSPP15924 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSPP15924 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSPP15924 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSPP15924 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DSPP15924 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSPP15924 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSPP15924 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSPP15924 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSPP15924 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSPP15924 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSPP15924 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSPP15924 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSPP15924 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSPP15924 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
DSPP15924 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSPP15924 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSPP15924 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
DSPP15924 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
DSPP15924 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSPP15924 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
DSPP15924 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms