Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC159P0C7I6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC159P0C7I6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms