Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP4O75161 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPHP4O75161 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms