Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCRIP1C9JLW8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms