Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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