Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms