Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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