Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms