Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms