Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms