Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms