Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms