Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms