Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms