Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms