Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms