Protein–RNA interactions for Protein: Q49A88

CCDC14, Coiled-coil domain-containing protein 14, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC14Q49A88 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC14Q49A88 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC14Q49A88 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms