Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
QSER1Q2KHR3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms