Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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