Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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