Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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