Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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