Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms