Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC005785.2-201ENST00000624655 631 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms