Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms