Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX6P78412 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX6P78412 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX6P78412 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX6P78412 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX6P78412 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX6P78412 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX6P78412 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX6P78412 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX6P78412 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX6P78412 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX6P78412 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX6P78412 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX6P78412 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX6P78412 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX6P78412 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX6P78412 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX6P78412 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX6P78412 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX6P78412 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX6P78412 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX6P78412 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX6P78412 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX6P78412 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX6P78412 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX6P78412 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX6P78412 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX6P78412 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX6P78412 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX6P78412 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX6P78412 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX6P78412 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IRX6P78412 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IRX6P78412 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IRX6P78412 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX6P78412 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX6P78412 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX6P78412 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX6P78412 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX6P78412 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX6P78412 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX6P78412 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX6P78412 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX6P78412 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX6P78412 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX6P78412 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX6P78412 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX6P78412 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX6P78412 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX6P78412 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX6P78412 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX6P78412 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX6P78412 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX6P78412 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX6P78412 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX6P78412 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX6P78412 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms