Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKP1P63208 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKP1P63208 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKP1P63208 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKP1P63208 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKP1P63208 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKP1P63208 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKP1P63208 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKP1P63208 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKP1P63208 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP1P63208 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP1P63208 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP1P63208 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP1P63208 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP1P63208 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP1P63208 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP1P63208 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP1P63208 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP1P63208 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP1P63208 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP1P63208 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms