Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms