Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPAP49450 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPAP49450 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPAP49450 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPAP49450 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPAP49450 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPAP49450 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPAP49450 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPAP49450 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPAP49450 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPAP49450 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPAP49450 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms