Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPAP38571 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPAP38571 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms