Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT1P21579 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT1P21579 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT1P21579 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT1P21579 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT1P21579 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT1P21579 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT1P21579 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT1P21579 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT1P21579 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT1P21579 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT1P21579 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT1P21579 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT1P21579 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT1P21579 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT1P21579 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT1P21579 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT1P21579 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT1P21579 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT1P21579 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT1P21579 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT1P21579 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT1P21579 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYT1P21579 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYT1P21579 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYT1P21579 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYT1P21579 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYT1P21579 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYT1P21579 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms