Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB4P17483 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB4P17483 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB4P17483 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB4P17483 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB4P17483 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB4P17483 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB4P17483 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB4P17483 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXB4P17483 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB4P17483 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB4P17483 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB4P17483 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB4P17483 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB4P17483 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB4P17483 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB4P17483 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB4P17483 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB4P17483 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB4P17483 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB4P17483 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB4P17483 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB4P17483 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB4P17483 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB4P17483 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXB4P17483 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB4P17483 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB4P17483 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXB4P17483 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB4P17483 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB4P17483 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms