Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF1P09603 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF1P09603 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF1P09603 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF1P09603 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF1P09603 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF1P09603 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF1P09603 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF1P09603 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF1P09603 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF1P09603 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF1P09603 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF1P09603 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF1P09603 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF1P09603 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF1P09603 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF1P09603 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF1P09603 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF1P09603 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF1P09603 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF1P09603 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF1P09603 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF1P09603 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF1P09603 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF1P09603 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF1P09603 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF1P09603 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF1P09603 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF1P09603 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms