Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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PKHD1P08F94 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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PKHD1P08F94 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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PKHD1P08F94 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
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PKHD1P08F94 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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PKHD1P08F94 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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